Abschlussarbeiten / Thesis
Dissertations
2025
Robert Dierkes Molecular and Functional Analysis of Novel Polyethylene Terephthalate (PET) – Degrading Enzymes and Development of a Highly-Sensitive Terephthalic Acid Biosensor for the Detection of Their Activity
Hongli Zhang Enriching the diversity of polyethylene terephthalate degrading enzymes from metagenomes
2024
Luise Grüterich Metagenomic and Metatranscriptomic Insights into Wetland Plant-Microbe Interactions and Dark CO2 Fixation (E-Dissertation)
Myllena Pereira Silverio Characterization of SusD-like proteins from the Phylum Bacteroidota and their ability to bind distinct polymers (E-Dissertation)
2023
Yekaterina Astafyeva Microalgae and Bacteria Interaction (E-Dissertation)
Eva Katharina Oellingrath Comparative Transcriptome Profiling of Expression Patterns and Regulation Mechanisms in the Plant Pathogen Burkholderia plantarii PG1 (E-Dissertation)
Marie K. Peters Discovery of novel marine enzymes for inhibition of biofilm formation of pathogen strains
2021
Hilke Duin Symbiotic plasmid (pNGR234a) copy number in the broad host range bacterium Sinorhizobium fredii NGR234 depends on quorum sensing and phenotypic heterogeneity (E-Dissertation)
Mirja Gudzuhn Stenotrophomonas maltophilia biofilms: Molecular keys to multicellularity, phenotypic heterogeneity and persistence on surfaces
2020
Andrea Schorn How to bark up the right tree – Novel metagenomic laccase-like multicopper oxidases from the European spruce bark beetle Ips typographus (E-Dissertation)
Katharina Saß Analysis of the microbial community and functionality along the Kermadec Arc and its surroundings
Nicole M. Adam Microbial hydrogen oxidation in deep-sea hydrothermal vents
Pablo Pérez-García Enzyme promiscuity at the origin of metallo-β-lactamases and within the α/β-hydrolase superfamily (E-Dissertation)
Katrin Petersen Quorum sensing-dependent expression of small proteins and structural analysis of new class of quorum quenching enzymes (E-Dissertation)
2019
Tanja Vanessa Heyer Development of a Whole Cell Fermentation Process for Glycosylation of Small Molecule Flavonoids (E-Dissertation)
Constantin Ruprecht Engineering Escherichia coli to glycosylate polyphenols
2018
Dominik Danso Function and Global Distribution of Polyethylene Terephthalate (PET)-Degrading Bacteria and Enzymes in Marine and Terrestrial Metagenomes (E-Dissertation)
Birhanu Kinfu Function-based searches for selected phosphotransferases and establishing in vitro transcription platform for cell-free metagenomics (E-Dissertation)
Simone Wegen Characterization of Candidatus Nitrotoga and its Competitiveness in Co-Culture with Nitrospira
2017
Jennifer Hüpeden Taxonomic and functional diversity of nitrifyingbiofilm communities in biofilters of different recirculatin aquaculture systems
2016
Jessica Grote Deciphering regulatory mechanisms involved in phenotypic heterogeneity of the autoinducer synthase genes traI and ngrI in Sinorhizobium fredii NGR234 using single cell technologies and RNA-seq (E-Dissertation)
Simon Güllert Deep metagenome and metatranscriptome analyses of plant biomassdegrading microbial communities to improve lignocellulose conversion (E-Dissertation)
Frederike S. Haack Genome, mutational and RNA-seq analyses of Janthinobacterium and Duganella strains reveal the presence of a single α-hydroxyketone-like quorum sensing system involved in bacterial-fungal interactions (E-Dissertation)
Moritz Hansen H2 oxidation as a novel trait among the sulfur-oxidizing Thiomicrospira lineage
Ebrahim Mama Abda Identifying molecular keys regulating phenotypic heterogeneity of Stenotrophomonas maltophilia K279a β-lactamase blaL1 and blaL2 gene expression (E-Dissertation)
2015
Hanaë A. Henke The Staphylococcus epidermidis biofilm matrix: functional components, molecular interactions and targeted enzymatic disruption (E-Dissertation)
Janine Maimanakos Vorkommen, Verbreitung und biochemische Charakterisierung bakterieller Arylmalonat- Decarboxylasen (E-Dissertation)
Gao Rong Genome-wide RNA-seq analysis of quorum sensing-dependent regulons in the plant-associated Bukholderia glumae strain PG1 (E-Dissertation)
Nicolas Rychlik Hydrogenases from a hydrothermal deep-sea vent metagenome and the development of a novel activity-based screen to identify H2 uptake active enzymes from metagenomic libraries
Christian Utpatel RNA-seq based identification and biochemical characterization of the Pseudomonas Aeruginosa LasR and quorum sensing anti-activator PA2226 (E-Dissertation)
2014
Stefanie Böhnke A novel function-based screen for detecting RubisCO active clones from metagenomic libraries: elucidating the role of RubisCO associated enzymes (E-Dissertation)
Julia Jürgensen Identification of an unusual GTase from a non-cultivated microorganism and the construction of an improved E. coli strain harboring the rpoD gene from C. cellulolyticum for metagenome searches (E-Dissertation)
Boris Nowka Activity and ecophysiology of nitrite-oxidizing bacteria in natural and engineered habitats (E-Dissertation)
2013
Claudia K. Hornung Violacein-producing Janthinobacterium sp. HH01 – Genome analysis revealed a novel α-hydroxyketone-sensing reporter-strain (E-Dissertation)
Ines Krohn-Molt Metagenomische und physiologische Analysen der Interaktion zwischen Mikroalgen und Bakterien in Photobioreaktoren (E-Dissertation)
Ulrich Rabausch Metagenome derived carbohydrate active enzymes for directed modification of polyphenols (E-Dissertation)
2012
Patrick Bijtenhoorn Characterization of novel metagenomic quorum quenching enzymes attenuating Pseudomonas aeruginosa motility, biofilm formation and virulence (E-Dissertation)
Jennifer Chow Biochemical and Structural Characterization Of Three Thermostable and Metagenome-Derived Lipolytic Enzymes (E-Dissertation)
Sandra Off Nitrospira Schlüsselorganismus der Nitritoxidation in gemäßigten und extremen Lebensräumen (E-Dissertation)
Arkadius Ozimek Durchmusterung von Metagenombibliotheken nach biotechnologisch relevanten Phytasen und Entwicklung eines EGFP-basierten Nachweisverfahrens
2011
Nele Ilmberger Metagenomic cellulases from Bacteria linking IL-tolerance, halotolerance and thermostability (E-Dissertation)
Sabine Keuter Characterization of nitrifying bacteria in marine recirculation aquaculture systems with regard to process optimization (E-Dissertation)
Dagmar Krysciak The complete genome sequence of Rhizobium sp. NGR234 reveals a surprisingly large number of quorum quenching associated genes (E-Dissertation)
2009
Julia Pottkämper Cellulase-Aktivitäten nicht-kultivierter Mikroorganismen in ionischen Flüssigkeiten
Christina Schipper Quorum Quenching und Anti-Biofilm Strategien aus Metagenom - Isolierung und Charakterisierung Quorum Sensing inhibierender Proteine aus Genbanken direkt isolierter Umwelt-DNA (E-Dissertation)
2006
Christian Elend Metagenombasierte Isolierung und biochemische Charakterisierung neuartiger stereospezifischer Lipasen für biokatalytische Anwendungen (E-Dissertation)
Sonja Voget Metagenomanalyse eines hydrolytischen Konsortiums: Identifizierung und biochemische Charakterisierung von Polysaccharid-abbauenden Biokatalysatoren aus nicht kultivierten Mikroorganismen (E-Dissertation)
2004
Christel Schmeißer (Vollstedt) Metagenomanalyse eines Multispezies-Biofilms: Biochemische Charakterisierung und Kristallisierung der ersten multimeren Esterase aus einem bisher nicht kultivierten Mikroorganismus (E-Dissertation)
Christian Stöckigt Konstruktion und Durchmusterung von Metagenombanken: Identifizierung und Charakterisierung von neuartigen amylolytischen Enzymen
2002
Elke Heinz Molekulare Analyse des Biotin-regulatorischen Netzwerks in Sinorhizobium meliloti durch Proteomanalyse, Expressionsstudien und Mutagenesen (E-Dissertation)
2001
Plamena Entcheva Umwelt-Genomik als Quelle für die Isolierung von neuen Operons und Genclustern aus mikrobiellen Konsortien (E-Dissertation)
Master & Diploma
2025
Lars Leifels Characterization and isolation of bacteria from enriched metagenomes of the Elbe estuary salt marsh
Oleksandra Tretiakova Etablierung von genetischen Tools in Vibrio gazogenes und Charakterisierung ausgewählter Mutanten
2024
Johannes Amann Antimicrobial candidates from microalgae and their potential against fish pathogens
Maria Gneuß Erstellung von Knock-out Mutanten in dem marinen Organismus Vibrio gazogenes zur Etablierung von Reportersystemen
Laura Schmitz Enhancement of enzymatic polyethylene terephthalate depolymerization by combination of phylogenetically distant hydrolases
Cara Schüer Peroxidases from the Metagenome of Tetraselmis chui – Exploring Antioxidative Effects for Health Management
Calvin Tu Proteomics analysis of the biofilm matrix of Stenotrophomonas maltophilia K279a
Jan Zinser Investigating the function of the hypothetical protein smlt2713 in the biofilm formation of bacteria of the species Stenotrophomonas maltophilia
2023
Albert Dumnitch Microbial and enzymatic degradation of polyester polyurethane achieved by rural and urban isolates and putative polyurethanases
Golo Feuerriegel PAZy: An Effort Towards Systematic Curation and Annotation of Plastics-Degrading Enzymes for Global Research Community
Martin A. Schumann Cloning and expression of putative unspecific peroxygenase genes from metagenomics in Pichia pastoris
Amos Tiemann Community composition and metabolic potential of microbes in tidal marshes of the Elbe Estuary
2022
Nico Bäse New Approaches for Enzymatic Degradation of Carbamates and Polyurethanes
Tabea Neumann SusD1 Binding to PET and its Influence on the Activity of PETases
Alina Nicolai Establishment and characterization of the CRISPRi gene silencing system in Burkholderia thailandensis E264
Michelle Savickis Analyse von mikrobiellen Gemeinschaften auf unterschiedlichen (Plastik-)Oberflächen und deren Einfluss auf die Besiedlung und die Biofilmstruktur
Alan Wypych Evaluation and optimisation of terephthalic acid responsive reporter strains for the screening of potential PET hydrolases based on the TPA-metabolism of Comamonas thiooxidans / Paraburkholderia xenovorans
Hannah Zimmermann Molekularbiologische Charakterisierung unterschiedlicher Vibrio-Stämme, mit Fokus auf Vibrio gazogenes, zur Analyse des Quorum Sensings
2021
Luise Grüterich Entwicklung hitzestabiler und O2-unabhängiger Fluoreszenzproteine und Wachstumsphasen-abhängige Transkriptomanalysen in Moorella thermoacetica
Marno Gurschke Establishment of mutagenesis experiments in Dyadobacter sp. HH091
Katharina Hoffmann Investigation of the bifunctionality of the quorum quenching enzyme GqqA from Komagataeibacter europaeusand related enzymes
Lena Preuß Establishment of novel antimicrobial and antibiofilm peptides from the microbiome of Scenedesmus communis
Prince Tete Metagenomische PETasen – Sequenzierung und Charakterisierung PET-hydrolysierender Enzyme aus Bakterien und Archaeen
Shamini R. Thirumalasetty Enzymatic Degradation of Polyethylene Terephthalate: Characterization of Novel Hydrolases from Proteobacteria and Validation of an Oxidative Approach
Sasipa Wongwattanarat Characterization of potential PET-degrading enzymes identified from metagenomes
2020
Lena-Luisa Nover Novel PET-esterases from the metagenome - Characterization and comparison to known PET-degrading enzymes
Lars Brandes Charakterisierung unterschiedlicher Mutanten des Typ VI Sekretionssystems von Janthinobacterium sp. HH102 in Hinblick auf den Phänotyp und den Einfluss auf die Bakterien-Pilz-Interaktion
Christoph Brieske Isolierung und Charakterisierung von Bakteriophagen für die Infektionsbehandlung
Robert Dierkes Shifting the nucleotide diphosphate sugar promiscuity of glycosyltransferase C towards dTDP-fucose for fucosylation of polyphenols
Tim Peuker Generation and screening of polyphenol rhamnosides with anti-biofilm properties
2019
Juana Eickholt Möglichkeiten zur Differenzierung zwischen Nitrosospira-Arten auf ökophysiologischer Ebene
Marcel Malinowski Analyse Ammoniak oxidierender Bakterien-Populationen in Elbsedimenten
Aizhan Mamyrova Erstellung von Deletionsmutanten im Typ VI Sekretionssystem von Janthinobacterium sp. HH102 und Untersuchung des daraus resultierenden Einflusses auf Fusarium graminearum
Laura Nissen Charakterisierung des Typ VI Sekretionssystems in Janthinobacterium sp. HH102 und dessen Einfluss auf das Wachstum des pflanzenpathogenen Pilzes Fusarium graminearum
Anna Ulatowski Untersuchungen zur Entwicklung eines Phase 2/Stufe 2-Testverfahrens zur Wirksamkeitsbewertung von Flächendesinfektionsmitteln mit mechanisch-chemischer Wirkkombination im Bereich Lebensmittel und Industrie
2018
Dominic Meier Identification and expression of novel metagenome-derived and rationally designed putative thermostable reverse transcriptases in E.coli BL21 (DE3)
Hongli Zhang Funktionsaufklärung der Hydroxyethylthiazole-Kinase (thiM9 im CRISPR-Cas Cluster von Burkholderia glumae PG1
2017
Laura Gust Evaluation von Pseudomonas aeruginosa als Instrument für die Funktionsaufklärung von hypothetischen Proteinen mittels RT-qPCR
Eva Oellingrath Quorum sensing abhängige Biofilmbildung und Sekretion in Burkholderia glumae PG1
Leonie Ruffert Optimierung und Weiterentwicklung des praxisnahem bakteriziden und viruziden Wirksamkeits-prüfverfahrens "4-Felder-Test" für die Wirksamkeitsbewertung von Flächendesinfektionsmitteltüchern
Gabriel Stiebellehner Quorum Sensing abhängige Regulation des CRISPR-Cas-Clusters in Burkholderia glumae PG1
2016
Pablo Pérez Gacía Cloning and heterologous expression of the crenarchaeal Ignicoccus hospitalis KIN4/I RNA-polymerase in the methylotrophic yeast Pichia pastoris
Nocholas J. Holzscheck Etablierung eines Expressionssystems für thermostabile archaeelle Hydrolasen
Marie Kristin Peters Klonierung und Charakterisierung von PET-Esterasen aus Bakterien verschiedener Phyla
2015
Stanislav Exner Biochemische Charakterisierung von zwei Esterasen aus Candidatus Nitrosophaera Gargensis
Katrin Petersen Identifizierung des janthinobakteriellen Autoinducer JAI-1 und Charakterisierung der neuen Janthinobacterium sp. Stämme HH100 - HH107
Lars Schröder Funtionelle Studien zur Quorum Sensing-abhängigen Expression der Transkriptionsregalatoren NgrR, ExpR und TraR
Jelka Tilsner Einfluss von Aminosäuren auf den Metabolismus humaner Haut
2014
Svenja Janssen Modifizierung eines laborgängigen E.coli Stammes zur Etablierung eines Nitrilase Screening Systems in E. coli
Anika Küttner Etablierung eines Screenings zur Identifizierung und Charakterisierung neuartiger Nitrilasen
2013
Andrea Schorn Fluoreszenzstudien mit GFP und RFP unter dem Einfluss unterschiedlicher Promotoren des Kommunikationssystems von Sinorhizobium fredii NGR234
2012
Joana Dannenberg Mutagenese Quorum-Sensing assoziierter Gene in Pseudomonas aeruginosa
Pascal Heitzmann Etablierung von genetischen Tools für Stenotrophomonas maltophilia
2011
Eva Mirow Untersuchungen Ammoniak oxidierender Bakterien aus oligotrophen Lebensräumen
Sabine Preuß Identifizierung und Charakterisierung AHL-abbauender Enzyme aus Rhizobium sp. NGR234
2010
Stefanie Böhnke Untersuchungen zur Struktur und Dynamik Ammoniak oxidierender Populationen in tidebeeinflussten Lebensräumen der Elbe
Ines Krohn Molekulare und ökophysiologische Charakterisierung bakterieller Populationen in Fließgewässern
Sabine Twesten Etablierung neuer prokaryotischer Expressionssysteme
Christian Utpatel Identifizierung und Charakterisierung von Quorum-Quenching-Genen aus Metagenomen
2009
Andreas Bonge Konstruktion von E. coli Reporterstämmen zur Durchmusterung von Metagenombanken undIdentifizierung von neuen Phytasen
Anne Himmelberg Isolierung und Charakterisierung neuartiger Cellulasen aus unkultivierten Bakterien
Janine Maimanakos Biochemische Charakterisierung einer neuartigen Phenylmalonat-Decarboxylase aus Variovorax sp. HH01
Thomas Meier Konstruktion von Metagenombanken aus ex-situ Kulturen von hydrothermalen Tiefseequellen
Jana Riethausen Biochemical characterisation of novel N-acyl homoserine lactone hydrolases from soil bacteria
Mariita F. Rodrigues Orbegoso Proteom- und Expressionsanalysen von Rhizobium sp. NGR234
Julia Steiger Biochemische Charakterisierung einer neuartigen Lactonhydrolase aus dem Gram-negativen Bodenbakterium Rhizobium sp. NGR234
2008
Jennifer Chow Isolierung von neuartigen thermophilen Enzymen für die Biokatalyse
Friederike M. Gründger Neuartige Cellulasen für die Biokatalyse aus dem Metagenom des Elefantenintestinaltraktes
2007
Sebastian Bertram Überexpression und biochemische Charakterisierung einer neuen Homoserinlaktonase aus Metagenomen
Axel Hinze Thermostabile Lipasen und Esterasen aus mesophilen Metagenomen
Sascha Horn Neuartige Phenylmalonsäure-Decarboxylasen aus Bodenbakterien
Claudia K. Hornung Molekulare und biochemische Charakterisierung eines Anti-Quorum Sensing-Gens aus dem Metagenom
Hans Ulrich Köhler Lipolytic enzymes from thermophilic enrichment cultures and metagenomes
Arkadius Ozimek Funktionale Genomanalysen des Megaplasmid 2 Replikons in Rhizobium sp. NGR234
2006
Ludy K. Cuellar Gomez Construction of a metagenomic library and screening for the presence of cellulases
Minna L. Eklund Isolation and characterisation of quorum quenching molecules from metagenomic DNA
Dagmar Krysciak Vector development for heterologous gene expression in rhizobial hosts
2004
Christina Schipper Isolierung und Charakterisierung von Anti-Quorumsensing-Molekülen aus metagenomischer DNA
2003
Susan Brandenburg Biofilmbildung bei Sinorhizobium meliloti
2002
Christian Elend Chromosomale Inaktivierung eines Corynebacterium glutamicum Restriktionssystems
Bachelor
2025
Golnoush Ghanbarzadeh Analyse der putativen BHETase UlaG aus Vibrio gazogenes anhand einer Promotorfusion
Lina A. Täger Untersuchung der Phagenanfälligkeit von klinischen Stenotrophomonas maltophilia-Isolaten und der Wirkung stammspezifischer Phagen auf Stenotrophomonas matophilia-Biofilme
2024
Marie Breuer Biofilm-Producing Bacteria as Platform for Surface-Localized delivery of Polymer-Degrading Enzymes
Magdalena Damps Charakterisierung verschiedener PETasen hinsichtlich ihrer Aktivität im Waschmittel
Lisann Doose Improving a cell-free protein synthesis system for high-throughput expression of metagenomic PETase candidates
Mihriban Kilic Binding of bacteroidetal SusD proteins to synthetic polymers including polyethylene terephthalate (PET) and their application in PETase chimeras
Tiago Marquez Funktionelles Screening und Charakterisierung potenzieller Polyamidasen aus Salzmarsch Metagenomen
Marcel Möller Einfluss von Bakteriophagen auf die Biofilmbildung von Stenotrophomonas maltophilia und Pseudomonas aeruginosa
Philip Noah Pirch Untersuchungen von Bakteriophagen und ihren Effekten auf pathogene bakterielle Biofilme
Kai Treichel Entwicklung stabiler Zelllinien, für den NanoBRET Readout-Counter-Assay, auf der Basis von HEK293-Zellen (humane embryonale Nierenzellen)
Cara Wonneberger Charakterisierung und Expression putativer Polyamid-abbauender Enzyme
Nuray Yel Isolierung und Charakterisierung von Phagen aus Umweltproben, sowie die Induktion eines Prophage aus Vibrio gazogenes
2023
Lina Andres Establishment of an Escherichia coli and Comamonas thiooxidans based screening pipeline for the rapid detection of Polyethylene terephthalate (PET) hydrolysis
Viktoriia Batih Identifizierung und Charakterisierung unterschiedlicher Mikroorganismen auf Plastikoberflächen
Lilli Becker Aufreinigung und Charakterisierung verschiedener Glykosyltransferasen aus dem Phylum Bacteroidota
Pia Blank Identifizierung und Charakterisierung verschiedener Mikroorganismen mit hydrolytischer Aktivität gegenüber unterschiedlichen (Bio-)Plastikpolymeren
Luca-Louise Hanlon Expression and Characterization of Potential PETDegrading Enzyme from Bacteroidetes
Colin Ochmann Expression and characterization of new putative polyethylene terephthalate (PET) degrading enzymes in E. coli
Kotorić Sadin Characterization of different Vibrio strains with regard to plastic colonization
2022
Julie M.Boeck Biochemische Charakterisierung der Enzymaktivität unterschiedlicher Prephenatdehydratasen im Hinblick auf die Quorum Quenching Funktion des bifunktionalen GqqAs aus dem Komogataeibacter europaeus
Theresa H. Böhlke Identifizierung und Charakterisierung Quorum Sensing relevanter Gene in Janthinobacterium sp. HH102
Lisa Haiduk Cloning and protein overexpression of metagenome-based endonucleases and deaminases and their biofilm-inhibitory effect on Edwardsiella anguillarum
Malin Henke Mikrobielle Enzyme zum Abbau von Urethanen
Ana Holbein In silico-Analyse mikrobieller Stoffwechselwege und Anreicherung anaerober Bakterien aus dem Marschboden des Elbeästuars
Nahuel Ibarra Enzymatischer Abbau von Polyurethan
Fabia R. Koch Analysis of the quorum sensing system in Vibrio gazogenes by using promotor fusions
Nicolas Krüger Isolierung und Charakterisierung von Bakterienspezies aus dem Phylum Bacteroidetes