Abschlussarbeiten

2025

Robert Dierkes Molecular and Functional Analysis of Novel Polyethylene Terephthalate (PET) – Degrading Enzymes and Development of a Highly-Sensitive Terephthalic Acid Biosensor for the Detection of Their Activity

Hongli Zhang Enriching the diversity of polyethylene terephthalate degrading enzymes from metagenomes

2024

Luise Grüterich Metagenomic and Metatranscriptomic Insights into Wetland Plant-Microbe Interactions and Dark CO2 Fixation (E-Dissertation)

Myllena Pereira Silverio Characterization of SusD-like proteins from the Phylum Bacteroidota and their ability to bind distinct polymers (E-Dissertation)

2023

Yekaterina Astafyeva Microalgae and Bacteria Interaction (E-Dissertation)

Eva Katharina Oellingrath Comparative Transcriptome Profiling of Expression Patterns and Regulation Mechanisms in the Plant Pathogen Burkholderia plantarii PG1 (E-Dissertation)

Marie K. Peters Discovery of novel marine enzymes for inhibition of biofilm formation of pathogen strains

2021

Hilke Duin Symbiotic plasmid (pNGR234a) copy number in the broad host range bacterium Sinorhizobium fredii NGR234 depends on quorum sensing and phenotypic heterogeneity (E-Dissertation)

Mirja Gudzuhn Stenotrophomonas maltophilia biofilms: Molecular keys to multicellularity, phenotypic heterogeneity and persistence on surfaces

2020

Andrea Schorn How to bark up the right tree – Novel metagenomic laccase-like multicopper oxidases from the European spruce bark beetle Ips typographus (E-Dissertation)

Katharina Saß Analysis of the microbial community and functionality along the Kermadec Arc and its surroundings

Nicole M. Adam Microbial hydrogen oxidation in deep-sea hydrothermal vents 

Pablo Pérez-García Enzyme promiscuity at the origin of metallo-β-lactamases and within the α/β-hydrolase superfamily (E-Dissertation)

Katrin Petersen Quorum sensing-dependent expression of small proteins and structural analysis of new class of quorum quenching enzymes (E-Dissertation)

2019

Tanja Vanessa Heyer Development of a Whole Cell Fermentation Process for Glycosylation of Small Molecule Flavonoids (E-Dissertation)

Constantin Ruprecht Engineering Escherichia coli to glycosylate polyphenols

2018

Dominik Danso Function and Global Distribution of Polyethylene Terephthalate (PET)-Degrading Bacteria and Enzymes in Marine and Terrestrial Metagenomes (E-Dissertation)

Birhanu Kinfu Function-based searches for selected phosphotransferases and establishing in vitro transcription platform for cell-free metagenomics (E-Dissertation)

Simone Wegen Characterization of Candidatus Nitrotoga and its Competitiveness in Co-Culture with Nitrospira

2017

Jennifer Hüpeden Taxonomic and functional diversity of nitrifyingbiofilm communities in biofilters of different recirculatin aquaculture systems

2016

Jessica Grote Deciphering regulatory mechanisms involved in phenotypic heterogeneity of the autoinducer synthase genes traI and ngrI in Sinorhizobium fredii NGR234 using single cell technologies and RNA-seq (E-Dissertation)

Simon Güllert Deep metagenome and metatranscriptome analyses of plant biomassdegrading microbial communities to improve lignocellulose conversion (E-Dissertation)

Frederike S. Haack Genome, mutational and RNA-seq analyses of Janthinobacterium and Duganella strains reveal the presence of a single α-hydroxyketone-like quorum sensing system involved in bacterial-fungal interactions (E-Dissertation)

Moritz Hansen H₂ oxidation as a novel trait among the sulfur-oxidizing Thiomicrospira lineage

Ebrahim Mama Abda Identifying molecular keys regulating phenotypic heterogeneity of Stenotrophomonas maltophilia K279a β-lactamase bla_L1 and bla_L2 gene expression (E-Dissertation)

2015

Hanaë A. Henke The Staphylococcus epidermidis biofilm matrix: functional components, molecular interactions and targeted enzymatic disruption (E-Dissertation)

Janine Maimanakos Vorkommen, Verbreitung und biochemische Charakterisierung bakterieller Arylmalonat- Decarboxylasen (E-Dissertation)

Gao Rong Genome-wide RNA-seq analysis of quorum sensing-dependent regulons in the plant-associated Bukholderia glumae strain PG1 (E-Dissertation)

Nicolas Rychlik Hydrogenases from a hydrothermal deep-sea vent metagenome and the development of a novel activity-based screen to identify H₂ uptake active enzymes from metagenomic libraries

Christian Utpatel RNA-seq based identification and biochemical characterization of the Pseudomonas Aeruginosa LasR and quorum sensing anti-activator PA2226 (E-Dissertation)

2014

Stefanie Böhnke A novel function-based screen for detecting RubisCO active clones from metagenomic libraries: elucidating the role of RubisCO associated enzymes (E-Dissertation)

Julia Jürgensen Identification of an unusual GTase from a non-cultivated microorganism and the construction of an improved E. coli strain harboring the rpoD gene from C. cellulolyticum for metagenome searches (E-Dissertation)

Boris Nowka Activity and ecophysiology of nitrite-oxidizing bacteria in natural and engineered habitats  (E-Dissertation)

2013

Claudia K. Hornung Violacein-producing Janthinobacterium sp. HH01 – Genome analysis revealed a novel α-hydroxyketone-sensing reporter-strain (E-Dissertation)

Ines Krohn-Molt Metagenomische und physiologische Analysen der Interaktion zwischen Mikroalgen und Bakterien in Photobioreaktoren  (E-Dissertation)

Ulrich Rabausch Metagenome derived carbohydrate active enzymes for directed modification of polyphenols  (E-Dissertation)

2012

Patrick Bijtenhoorn Characterization of novel metagenomic quorum quenching enzymes attenuating Pseudomonas aeruginosa motility, biofilm formation and virulence (E-Dissertation)

Jennifer Chow Biochemical and Structural Characterization Of Three Thermostable and Metagenome-Derived Lipolytic Enzymes (E-Dissertation)

Sandra Off Nitrospira Schlüsselorganismus der Nitritoxidation in gemäßigten und extremen Lebensräumen  (E-Dissertation)

Arkadius Ozimek Durchmusterung von Metagenombibliotheken nach biotechnologisch relevanten Phytasen und Entwicklung eines EGFP-basierten Nachweisverfahrens 

2011

Nele Ilmberger Metagenomic cellulases from Bacteria linking IL-tolerance, halotolerance and thermostability (E-Dissertation)

Sabine Keuter Characterization of nitrifying bacteria in marine recirculation aquaculture systems with regard to process optimization (E-Dissertation)

Dagmar Krysciak The complete genome sequence of Rhizobium sp. NGR234 reveals a surprisingly large number of quorum quenching associated genes (E-Dissertation)

2009

Julia Pottkämper Cellulase-Aktivitäten nicht-kultivierter Mikroorganismen in ionischen Flüssigkeiten

Christina Schipper Quorum Quenching und Anti-Biofilm Strategien aus Metagenom - Isolierung und Charakterisierung Quorum Sensing inhibierender Proteine aus Genbanken direkt isolierter Umwelt-DNA (E-Dissertation)

2006

Christian Elend Metagenombasierte Isolierung und biochemische Charakterisierung neuartiger stereospezifischer Lipasen für biokatalytische Anwendungen (E-Dissertation)

Sonja Voget Metagenomanalyse eines hydrolytischen Konsortiums: Identifizierung und biochemische Charakterisierung von Polysaccharid-abbauenden Biokatalysatoren aus nicht kultivierten Mikroorganismen (E-Dissertation)

2004

Christel Schmeißer (Vollstedt) Metagenomanalyse eines Multispezies-Biofilms: Biochemische Charakterisierung und Kristallisierung der ersten multimeren Esterase aus einem bisher nicht kultivierten Mikroorganismus (E-Dissertation)

Christian Stöckigt Konstruktion und Durchmusterung von Metagenombanken: Identifizierung und Charakterisierung von neuartigen amylolytischen Enzymen

2002

Elke Heinz Molekulare Analyse des Biotin-regulatorischen Netzwerks in Sinorhizobium meliloti durch Proteomanalyse, Expressionsstudien und Mutagenesen (E-Dissertation)

2001

Plamena Entcheva Umwelt-Genomik als Quelle für die Isolierung von neuen Operons und Genclustern aus mikrobiellen Konsortien (E-Dissertation)

2025

Lars Leifels Characterization and isolation of bacteria from enriched metagenomes of the Elbe estuary salt marsh

Oleksandra Tretiakova Etablierung von genetischen Tools in Vibrio gazogenes und Charakterisierung ausgewählter Mutanten

2024

Johannes Amann Antimicrobial candidates from microalgae and their potential against fish pathogens

Maria Gneuß Erstellung von Knock-out Mutanten in dem marinen Organismus Vibrio gazogenes zur Etablierung von Reportersystemen

Laura Schmitz Enhancement of enzymatic polyethylene terephthalate depolymerization by combination of phylogenetically distant hydrolases

Cara Schüer Peroxidases from the Metagenome of Tetraselmis chui – Exploring Antioxidative Effects for Health Management

Calvin Tu Proteomics analysis of the biofilm matrix of Stenotrophomonas maltophilia K279a

Jan Zinser Investigating the function of the hypothetical protein smlt2713 in the biofilm formation of bacteria of the species Stenotrophomonas maltophilia

2023

Albert Dumnitch Microbial and enzymatic degradation of polyester polyurethane achieved by rural and urban isolates and putative polyurethanases

Golo Feuerriegel PAZy: An Effort Towards Systematic Curation and Annotation of Plastics-Degrading Enzymes for Global Research Community

Martin A. Schumann Cloning and expression of putative unspecific peroxygenase genes from metagenomics in Pichia pastoris

Amos Tiemann Community composition and metabolic potential of microbes in tidal marshes of the Elbe Estuary

2022

Nico Bäse New Approaches for Enzymatic Degradation of Carbamates and Polyurethanes

Tabea Neumann SusD1 Binding to PET and its Influence on the Activity of PETases

Alina Nicolai Establishment and characterization of the CRISPRi gene silencing system in Burkholderia thailandensis E264

Michelle Savickis Analyse von mikrobiellen Gemeinschaften auf unterschiedlichen (Plastik-)Oberflächen und deren Einfluss auf die Besiedlung und die Biofilmstruktur

Alan Wypych Evaluation and optimisation of terephthalic acid responsive reporter strains for the screening of potential PET hydrolases based on the TPA-metabolism of Comamonas thiooxidans / Paraburkholderia xenovorans

Hannah Zimmermann Molekularbiologische Charakterisierung unterschiedlicher Vibrio-Stämme, mit Fokus auf Vibrio gazogenes, zur Analyse des Quorum Sensings

2021

Luise Grüterich Entwicklung hitzestabiler und O2-unabhängiger Fluoreszenzproteine und Wachstumsphasen-abhängige Transkriptomanalysen in Moorella thermoacetica

Marno Gurschke Establishment of mutagenesis experiments in Dyadobacter sp. HH091

Katharina Hoffmann Investigation of the bifunctionality of the quorum quenching enzyme GqqA from Komagataeibacter europaeusand related enzymes

Lena Preuß Establishment of novel antimicrobial and antibiofilm peptides from the microbiome of Scenedesmus communis

Prince Tete Metagenomische PETasen – Sequenzierung und Charakterisierung PET-hydrolysierender Enzyme aus Bakterien und Archaeen

Shamini R. Thirumalasetty Enzymatic Degradation of Polyethylene Terephthalate: Characterization of Novel Hydrolases from Proteobacteria and Validation of an Oxidative Approach

Sasipa Wongwattanarat Characterization of potential PET-degrading enzymes identified from metagenomes

2020

Lena-Luisa Nover Novel PET-esterases from the metagenome - Characterization and comparison to known PET-degrading enzymes

Lars Brandes Charakterisierung unterschiedlicher Mutanten des Typ VI Sekretionssystems von Janthinobacterium sp. HH102 in Hinblick auf den Phänotyp und den Einfluss auf die Bakterien-Pilz-Interaktion

Christoph Brieske Isolierung und Charakterisierung von Bakteriophagen für die Infektionsbehandlung

Robert Dierkes Shifting the nucleotide diphosphate sugar promiscuity of glycosyltransferase C towards dTDP-fucose for fucosylation of polyphenols

Tim Peuker Generation and screening of polyphenol rhamnosides with anti-biofilm properties

2019

Juana Eickholt Möglichkeiten zur Differenzierung zwischen Nitrosospira-Arten auf ökophysiologischer Ebene

Marcel Malinowski Analyse Ammoniak oxidierender Bakterien-Populationen in Elbsedimenten

Aizhan Mamyrova Erstellung von Deletionsmutanten im Typ VI Sekretionssystem von Janthinobacterium sp. HH102 und Untersuchung des daraus resultierenden Einflusses auf Fusarium graminearum

Laura Nissen Charakterisierung des Typ VI Sekretionssystems in Janthinobacterium sp. HH102 und dessen Einfluss auf das Wachstum des pflanzenpathogenen Pilzes Fusarium graminearum

Anna Ulatowski Untersuchungen zur Entwicklung eines Phase 2/Stufe 2-Testverfahrens zur Wirksamkeitsbewertung von Flächendesinfektionsmitteln mit mechanisch-chemischer Wirkkombination im Bereich Lebensmittel und Industrie

2018

Dominic Meier Identification and expression of novel metagenome-derived and rationally designed putative thermostable reverse transcriptases in E.coli BL21 (DE3)

Hongli Zhang Funktionsaufklärung der Hydroxyethylthiazole-Kinase (thiM9 im CRISPR-Cas Cluster von Burkholderia glumae PG1

2017

Laura Gust Evaluation von Pseudomonas aeruginosa als Instrument für die Funktionsaufklärung von hypothetischen Proteinen mittels RT-qPCR

Eva Oellingrath Quorum sensing abhängige Biofilmbildung und Sekretion in Burkholderia glumae PG1

Leonie Ruffert Optimierung und Weiterentwicklung des praxisnahem bakteriziden und viruziden Wirksamkeits-prüfverfahrens "4-Felder-Test" für die Wirksamkeitsbewertung von Flächendesinfektionsmitteltüchern

Gabriel Stiebellehner Quorum Sensing abhängige Regulation des CRISPR-Cas-Clusters in Burkholderia glumae PG1

2016

Pablo Pérez Gacía Cloning and heterologous expression of the crenarchaeal Ignicoccus hospitalis KIN4/I RNA-polymerase in the methylotrophic yeast Pichia pastoris

Nocholas J. Holzscheck Etablierung eines Expressionssystems für thermostabile archaeelle Hydrolasen

Marie Kristin Peters Klonierung und Charakterisierung von PET-Esterasen aus Bakterien verschiedener Phyla

2015

Stanislav Exner Biochemische Charakterisierung von zwei Esterasen aus Candidatus Nitrosophaera Gargensis

Katrin Petersen Identifizierung des janthinobakteriellen Autoinducer JAI-1 und Charakterisierung der neuen Janthinobacterium sp. Stämme HH100 - HH107

Lars Schröder Funtionelle Studien zur Quorum Sensing-abhängigen Expression der Transkriptionsregalatoren NgrR, ExpR und TraR

Jelka Tilsner Einfluss von Aminosäuren auf den Metabolismus humaner Haut

2014

Svenja Janssen Modifizierung eines laborgängigen E.coli Stammes zur Etablierung eines Nitrilase Screening Systems in E. coli

Anika Küttner Etablierung eines Screenings zur Identifizierung und Charakterisierung neuartiger Nitrilasen

2013

Andrea Schorn Fluoreszenzstudien mit GFP und RFP unter dem Einfluss unterschiedlicher Promotoren des Kommunikationssystems von Sinorhizobium fredii NGR234

2012

Joana Dannenberg Mutagenese Quorum-Sensing assoziierter Gene in Pseudomonas aeruginosa

Pascal Heitzmann Etablierung von genetischen Tools für Stenotrophomonas maltophilia

2011

Eva Mirow Untersuchungen Ammoniak oxidierender Bakterien aus oligotrophen Lebensräumen

Sabine Preuß Identifizierung und Charakterisierung AHL-abbauender Enzyme aus Rhizobium sp. NGR234

2010

Stefanie Böhnke Untersuchungen zur Struktur und Dynamik Ammoniak oxidierender Populationen in tidebeeinflussten Lebensräumen der Elbe

Ines Krohn Molekulare und ökophysiologische Charakterisierung bakterieller Populationen in Fließgewässern

Sabine Twesten Etablierung neuer prokaryotischer Expressionssysteme

Christian Utpatel Identifizierung und Charakterisierung von Quorum-Quenching-Genen aus Metagenomen

2009

Andreas Bonge Konstruktion von E. coli Reporterstämmen zur Durchmusterung von Metagenombanken undIdentifizierung von neuen Phytasen

Anne Himmelberg Isolierung und Charakterisierung neuartiger Cellulasen aus unkultivierten Bakterien

Janine Maimanakos Biochemische Charakterisierung einer neuartigen Phenylmalonat-Decarboxylase aus Variovorax sp. HH01

Thomas Meier Konstruktion von Metagenombanken aus ex-situ Kulturen von hydrothermalen Tiefseequellen

Jana Riethausen Biochemical characterisation of novel N-acyl homoserine lactone hydrolases from soil bacteria

Mariita F. Rodrigues Orbegoso Proteom- und Expressionsanalysen von Rhizobium sp. NGR234

Julia Steiger Biochemische Charakterisierung einer neuartigen Lactonhydrolase aus dem Gram-negativen Bodenbakterium Rhizobium sp. NGR234

2008

Jennifer Chow Isolierung von neuartigen thermophilen Enzymen für die Biokatalyse

Friederike M. Gründger Neuartige Cellulasen für die Biokatalyse aus dem Metagenom des Elefantenintestinaltraktes

2007

Sebastian Bertram Überexpression und biochemische Charakterisierung einer neuen Homoserinlaktonase aus Metagenomen

Axel Hinze Thermostabile Lipasen und Esterasen aus mesophilen Metagenomen

Sascha Horn Neuartige Phenylmalonsäure-Decarboxylasen aus Bodenbakterien

Claudia K. Hornung Molekulare und biochemische Charakterisierung eines Anti-Quorum Sensing-Gens aus dem Metagenom

Hans Ulrich Köhler Lipolytic enzymes from thermophilic enrichment cultures and metagenomes

Arkadius Ozimek Funktionale Genomanalysen des Megaplasmid 2 Replikons in Rhizobium sp. NGR234

2006

Ludy K. Cuellar Gomez Construction of a metagenomic library and screening for the presence of cellulases

Minna L. Eklund Isolation and characterisation of quorum quenching molecules from metagenomic DNA

Dagmar Krysciak Vector development for heterologous gene expression in rhizobial hosts

2004

Christina Schipper Isolierung und Charakterisierung von Anti-Quorumsensing-Molekülen aus metagenomischer DNA

2003

Susan Brandenburg Biofilmbildung bei Sinorhizobium meliloti

2002

Christian Elend Chromosomale Inaktivierung eines Corynebacterium glutamicum Restriktionssystems