Genominformatik
Herzlich Willkommen!
Arbeitsgruppenleiter: Prof. Dr. Stefan Kurtz
Der allgemeine Fokus im Arbeitsgebiet Genominformatik liegt heutzutage bei der Analyse von großen Mengen von Sequenzen (Short Reads), die durch die neuen Sequenzierungstechnologien im industriellen Maßstab produziert werden. Die schnelle Verbreitung dieser Technologien hat zu einer großen Zahl von neuen Anwendungen geführt, durch die wiederum neue wissenschaftliche Probleme in der Analyse und Integration der entstehenden Daten generiert wurden.
Die Arbeitsgruppe Genominformatik arbeitet an der Entwicklung und Anwendung von neuen Algorithmen und Datenstrukturen sowie flexiblen Softwaresystemen, um einige dieser Probleme zu lösen, hauptsächlich im Bereich Assemblierung und effiziente Speicherung von Short Reads. Außerdem
arbeitet die Gruppe an Problemen in Bereich des Genomvergleichs, sowie in Anwendungsprojekten mit Kooperationspartnern aus den Lebenswissenschaften an der Analyse von Short Reads, die aus metagenomischen Proben sequenziert wurden.