Erfolgreich zweckentfremdet: Virale dsRNA kann mit gDNA Kits isoliert werdenPublikation

20. Oktober 2023, von Website Team Biologie

Foto: TL

Mykovirologen*innen beschäftigen sich mit Viren, die Pilze infizieren. Ein Virusbefall kann bei Zuchtpilzen zu Ernteverlusten führen. Mykoviren sind aber auch deswegen interessant, weil sie phytopathogene Pilze wie Fusarium graminearum, der auf verschiedenen Getreidearten Schäden verursacht, befallen können. Ein Virusbefall eines phytopathogenen Pilzes unterdrückt im Idealfall seine Pathogenität und kann als biologisches Pflanzenschutzmittel eingesetzt werden. Es gibt also gute Gründe, um mit Mykoviren zu arbeiten. Da diese meist ihre Gene auf doppelsträngiger RNA (dsRNA) kodieren, ist es für Mykovirologen*innen wichtig, diese dsRNA isolieren zu können.

Viele Labors arbeiten mit selbst entwickelten und aufwändigen Methoden. Bis vor kurzem wurde auch ein kommerziell erhältlicher Kit angeboten. Da die Produktion dieses Kits eingestellt wurde, haben wir verschiedene kommerzielle Kits zur Extraktion von Nukleinsäuren getestet. Die Frage war ob wir mit diesen auch dsRNA in guter Qualität und mit geringem Aufwand erhalten. Am Beispiel zweier Mykoviren konnten wir zeigen, dass die Kits zweier Anbieter zur Isolierung genomischer DNA von Pflanzen auch hervorragend zur Isolierung von viraler dsRNA geeignet sind. Diese Ergebnisse wird nicht nur Mykovirologen den Laboralltag erleichtern, auch Pflanzenvirologen können wahrscheinlich davon profitieren.

Zur Publikation